Catherine Halsey nació en un planeta desconocido el 19 de Marzo de 2492. No se sabe mucho sobre su vida anterior, pero lo poco que se sabe da una idea de lo que sería una carrera prometedora. En sus propias palabras fue "...más inteligente que sus padres, siempre leyendo, hablando, aprendiendo y con ganas de compartir conocimientos con cualquiera que quisiera escucharlo". En 2507, a la edad de 15 años, la Dra. Halsey ya estaba escribiendo su segundo trabajo de Tesis Doctoral, en la que habló sobre la línea de comandos arcaicos. También se sabe que en algún momento de su vida temprana supervisó la creación de la tercera generación de IA Inteligentes. Fue alumna estrella del Vicealmirante Ysionris Jeromi. En Agosto de 2510, Halsey compró un pequeño diario, de tapa dura, en una tienda de Reach, cerca de donde estaba ella. Halsey usó el diario como un medio a través del cual poder expresar sus pensamientos y preocupaciones, así como notas importantes de su investigación durante otros cuarenta y dos años, hasta que lo abandonó durante su escape de la Base Sword. El diario fue recuperado más tarde por laONI en 2553, y fue designado como secreto. Durante sus viajes de estudio para los candidatos Spartans, Halsey creció adjunta con el Teniente Menor Jacob Keyes. Los dos estuvieron involucrados en una relación amorosa en 2520, y en 2525, Halsey dio a luz a Miranda y la crió por algunos años, cuando el 12 de Junio de 2531 el padre de Miranda aceptó criarla en la Luna. Más tarde, Halsey tuvo una pelea con Miranda, quien luego cambió su apellido paterno y se negó a hablar con Halsey durante años.
Proyecto SPARTAN-II
Este niño podría valer más para la UNSC que una flota de destructores, un millar de Tenientes, e incluso más que yo, al final, el niño puede ser lo único que haga una diferencia
~Catherine Halsey hablando con el Teniente Menor Jacob Keyes, refiriéndose a John-117 en la ciudad Elysum.
La Dra. Halsey sirvió como Asesora Científica de la ONI desde 2515 hasta 2522, cuando fue nombrada Jefa Científica. Ella hizo enormes contribuciones a muchos proyectos de la ONI Sección III, incluyendo la creación e implementación de las construcciones IA. También creó e inició el Proyecto SPARTAN-II, así como el desarrollo de la Armadura de Combate MJOLNIR. Todos ellos resultaron ser importantes acontecimientos para la UNSC, y para la supervivencia de la humanidad.
En 2517, a la edad de 25 años, la Dra. Halsey se convirtió en la creadora del Proyecto SPARTAN-II, y se construyó una serie de rigurosos requisitos genéticos que todos los candidatos potenciales del programa estaban obligados a cumplir. A partir de estos requisitos, se identificaron 150 candidatos, pero la ONI solo le daría fondos suficientes para capacitar 75 de ellos. Ella reconoció a cada uno de los candidatos y determinó cuales de los 75 serían. El Teniente Menor Jacob Keyes la acompañó durante la entrevista de John-117. Luego se llevó a los niños en secreto y los trasladó al planeta Reach para su formación. Todos los niños fueron reemplazados por clones-flash, que mueren en un momento determinado, debido a las diversas enfermedades neurológicas y fisiológicas.
Con la ayuda del Suboficial Franklin Mendez y la Inteligencia Artificial Deja, se procedió a entrenar a los Spartans. Ella supervisó los Procedimientos de Aumento, el Entrenamiento de Combate, la Educación y estudió
los efectos del estilo de vida Spartan en los niños. Mantuvo un estrecho contacto con ellos durante toda su vida, desde su base con arreglo al sistema. Siempre fue capaz de distinguirlos unos de otros, incluso cuando la mitad de ellos estaba en su Armadura de Batalla MJOLNIR. La Dra. Halsey los nombra por su primer nombre, nunca rangos o placas de identificación. Esto reveló que había una enorme cantidad de respeto hacia ellos; también era capaz de ordenarlos y los Spartans se refieren a Halsey como "señora", que es otra forma de respeto que le muestran, sin mencionar que los Spartans la ven como una figura materna. Ella también conocía muchos de los secretos de los Spartans de su vida anterior, como ella le contaba muchos de sus secretos a los Spartans, como el código de seguridad Oly Oly Oxen Free.
Captura
La doctora fue capturada por el Covenant en 2544 durante la batalla en el planeta Miridem por que un Ossona pirateó sus archivos y enviaron a los Profetas, y éstos la mandaron capturar. Cuando la capturaron la criogenizaron. La rescataron los Spartans Kelly-087, Frederic-104, Solomon-069 y Arthur-079,al mando de John-117 la rescataron, pero con la trágica muerte de Solomon y Arthur.
El equipo Spartan Azul tuvo que entrar en una nave de asalto del Covenant para salvarla.
Creación de Cortana
Halsey quiso hacer una IA avanzada que pudiera proteger datos
valiosos de la ONI, y que fuera compatible con el nuevo programa MARK V, que es la conexión de IA- Spartan, Halsey hizo algo que va contra la moral y la suya, que fue clonar su cerebro para hacer a la IA. La nueva IA era como Halsey, pero cuando era mucho más joven. La IA se hacía llamar Cortana; Halsey guardó en secreto eso, ella admitía que se sentía preocupada (y ligeramente asustada), ya que la ponía nerviosa verse a sí misma desarrollarse en la incubadora de IA´s. Cuando completó su desarrollo llegaron los Noble a sacar a Halsey y a Cortana, que escogió a Noble Seis para ser el portador de ella; finalmente Seis entrega a Cortana a Jacob Keyes.
(Esta información es inexacta, ya que en los libros se explica que Cortana ya había conocido a John-117 antes de convertirse en la IA del Pillar of Autumm, según la información que cuenta la historia de Halo: The Fall of Reach, y además la Dra. Halsey jamás supo de la existencia del equipo Noble ni del resto de los Spartan-III). Es posible que el hecho de que la IA Cortana mencione conocer a John-117 sea en referencia a que ella (según su propia mención) está hecha de "pensamientos y recuerdos robados" (Halo 3) de tal forma que el hecho que la Doctora Halsey haya conocido al Master Chief hace que Cortana también lo recuerde.
Diario de Halsey
Halsey compró un diario en Reach, en una tienda de curiosidades, y en él relató varios sucesos que ocurrieron desde la captura de candidatos Spartan-II hasta la evacuación de su laboratorio subterráneo por el Equipo Noble. En el transcurso del diario relata su trabajo y de cómo invadió y masacró el Covenant a colonias como Harvest.
Caída de Reach
En Reach, en el videojuego aparece ella. En el video de una misión se muestra que a los Spartans Carter, Jun, Emile y Noble Seis (los demás integrantes del equipo ya habían muerto) les habla la inteligencia artificial (Doth), que les muestra un pasadizo secreto hacia el laboratorio de Halsey (los Spartan la creían muerta), donde ella se encontraba escondida y terminando de poner los datos a Cortana para que se la llevaran a Keyes en el Pillar of Autumm fuera del planeta Reach, ya que estaba a punto de caer. Pero en el vídeo se muestra que hay dos Pelicans; en uno se van Carter, Emile y Six, y en el otro Jun y Halsey, pero antes sin encargarle Carter a Jun que protegiera a la doctora, pero diciendo Jun que haría todo lo posible, y se van. Jun escoltó a Halsey en otro Pelican y se dirigen a la base el castillo donde los esperaban para una misión. Jun es el único Spartan (del equipo noble) que supuestamente sobrevive.
Prisionera de Guerra
Al terminar la Guerra Humano-Covenant, la doctora Halsey fue atrapada por la ONI y acusada de secuestrar a los SPARTAN-II, posteriomente se le dio la libertad condicional para ayudar a construir la UNSC Infinity, que al ser terminada nuevamente fue puesta en prisión. Seis meses después del incidente de New Phoenix, Halsey es llevada a la Infinity en Requiem para analizar el artefacto. Halsey lo usó para comunicarse con Jul 'Mdama e intentar despertar a la Bibliotecaria. Tras manipular a Roland, Halsey escapa y se comunica con 'Mdama para llegar a un acuerdo, pero es descubierta por Lasky. Mientras analizaba los informes de la Bibliotecaria descubre que John-117 sigue vivo, en un criotubo en la Infinity. Tras llegar al puente, un Caballero Prometeo se lleva a Halsey a Requiem (el Artefacto habia creado un conducto desliespacial hasta Requiem permitiendo el abordale de los prometeos), todo esto planeado por ella para tener acceso a la Bibliotecaria. Posteriormente, despierta a la Bibliotecaria y recibe de ella la "llave" de Requiem.
Al salir, le da media llave a Thorne y en medio del tiroteo es herida por Palmer (tenía órdenes de matarla). Jul la secuestra y escapan de Requiem. Posteriormente, se ve a Halsey sin su brazo, diciendo a 'Mdama que quiere venganza a cambio de colaborarles.
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